Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trim44Q9QXA7 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms