Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Homer2Q9QWW1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms