Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rai2Q9QVY8 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms