Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Higd1aQ9JLR9 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Higd1aQ9JLR9 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Higd1aQ9JLR9 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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