Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLL3

Tnfrsf19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf19Q9JLL3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfrsf19Q9JLL3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms