Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK4

Cabp2, Calcium-binding protein 2, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp2Q9JLK4 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Cabp2Q9JLK4 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms