Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Col5a3Q9JLI2 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Col5a3Q9JLI2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Col5a3Q9JLI2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Col5a3Q9JLI2 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Col5a3Q9JLI2 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Col5a3Q9JLI2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col5a3Q9JLI2 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Col5a3Q9JLI2 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms