Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4Q9JLH8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmod4Q9JLH8 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmod4Q9JLH8 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmod4Q9JLH8 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmod4Q9JLH8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tmod4Q9JLH8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmod4Q9JLH8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmod4Q9JLH8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmod4Q9JLH8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmod4Q9JLH8 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmod4Q9JLH8 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmod4Q9JLH8 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmod4Q9JLH8 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmod4Q9JLH8 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmod4Q9JLH8 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmod4Q9JLH8 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmod4Q9JLH8 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmod4Q9JLH8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmod4Q9JLH8 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmod4Q9JLH8 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmod4Q9JLH8 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmod4Q9JLH8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmod4Q9JLH8 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmod4Q9JLH8 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmod4Q9JLH8 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmod4Q9JLH8 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmod4Q9JLH8 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmod4Q9JLH8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmod4Q9JLH8 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmod4Q9JLH8 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmod4Q9JLH8 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmod4Q9JLH8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmod4Q9JLH8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmod4Q9JLH8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmod4Q9JLH8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmod4Q9JLH8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmod4Q9JLH8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmod4Q9JLH8 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmod4Q9JLH8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmod4Q9JLH8 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tmod4Q9JLH8 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmod4Q9JLH8 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmod4Q9JLH8 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmod4Q9JLH8 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmod4Q9JLH8 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmod4Q9JLH8 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmod4Q9JLH8 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmod4Q9JLH8 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmod4Q9JLH8 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmod4Q9JLH8 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmod4Q9JLH8 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmod4Q9JLH8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tmod4Q9JLH8 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmod4Q9JLH8 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmod4Q9JLH8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmod4Q9JLH8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmod4Q9JLH8 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmod4Q9JLH8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmod4Q9JLH8 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmod4Q9JLH8 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmod4Q9JLH8 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmod4Q9JLH8 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmod4Q9JLH8 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmod4Q9JLH8 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmod4Q9JLH8 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmod4Q9JLH8 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmod4Q9JLH8 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmod4Q9JLH8 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmod4Q9JLH8 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmod4Q9JLH8 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmod4Q9JLH8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmod4Q9JLH8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmod4Q9JLH8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmod4Q9JLH8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmod4Q9JLH8 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmod4Q9JLH8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmod4Q9JLH8 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmod4Q9JLH8 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmod4Q9JLH8 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmod4Q9JLH8 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmod4Q9JLH8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmod4Q9JLH8 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmod4Q9JLH8 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmod4Q9JLH8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmod4Q9JLH8 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmod4Q9JLH8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmod4Q9JLH8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmod4Q9JLH8 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmod4Q9JLH8 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmod4Q9JLH8 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmod4Q9JLH8 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmod4Q9JLH8 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmod4Q9JLH8 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmod4Q9JLH8 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmod4Q9JLH8 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmod4Q9JLH8 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmod4Q9JLH8 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmod4Q9JLH8 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmod4Q9JLH8 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmod4Q9JLH8 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms