Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Gm22993-201ENSMUST00000175423 254 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Irx5Q9JKQ4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.5 ms