Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Msgn1Q9JK54 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Msgn1Q9JK54 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms