Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gfra4Q9JJT2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gfra4Q9JJT2 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms