Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF6

Efcc1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcc1Q9JJF6 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Efcc1Q9JJF6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Efcc1Q9JJF6 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms