Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pus3Q9JI38 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pus3Q9JI38 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms