Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tcirg1Q9JHF5 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms