Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn12Q9ET43 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms