Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET37

Slc5a4a, Solute carrier family 5 member 4A, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a4aQ9ET37 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Slc5a4aQ9ET37 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms