Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ16

Cxcr6, C-X-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr6Q9EQ16 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cxcr6Q9EQ16 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms