Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rnft1Q9DCN7 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Rnft1Q9DCN7 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms