Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH2

Pop7, Ribonuclease P protein subunit p20, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop7Q9DCH2 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pop7Q9DCH2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Pop7Q9DCH2 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms