Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Acss2os-201ENSMUST00000148685 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Ccl20-203ENSMUST00000186832 772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Gm28962-201ENSMUST00000187993 621 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Gm3116-201ENSMUST00000189440 1116 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Gm28692-202ENSMUST00000189645 621 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Gm37740-202ENSMUST00000194757 621 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Gm17415-201ENSMUST00000096427 789 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Aebp2-205ENSMUST00000160836 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 E330011O21Rik-204ENSMUST00000210839 1361 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Gm44090-201ENSMUST00000204669 1834 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Vmn1r37-203ENSMUST00000226886 1308 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Olfr1140-201ENSMUST00000214723 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Serpina3a-202ENSMUST00000109965 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Gm14746-201ENSMUST00000120309 741 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Gm12637-201ENSMUST00000130501 368 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Gm33571-201ENSMUST00000193271 657 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Gm42783-201ENSMUST00000197075 795 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Vmn1r76-201ENSMUST00000058772 975 ntAPPRIS P2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Olfr955-203ENSMUST00000220176 1452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Gm39321-203ENSMUST00000217090 1575 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Gm8177-201ENSMUST00000181591 1336 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Gm14098-201ENSMUST00000119295 623 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Sval2-203ENSMUST00000120605 497 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Gm37599-201ENSMUST00000193067 489 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Gm18329-201ENSMUST00000215832 589 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 AC147101.1-201ENSMUST00000217964 312 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Ppbp-201ENSMUST00000031319 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Gpr87-201ENSMUST00000056898 1080 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Olfr829-201ENSMUST00000058411 966 ntAPPRIS P2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Gm42852-201ENSMUST00000202649 1379 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Riok3Q9DBU3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms