Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Smg9Q9DB90 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smg9Q9DB90 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Smg9Q9DB90 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Smg9Q9DB90 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Smg9Q9DB90 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Smg9Q9DB90 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Smg9Q9DB90 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Smg9Q9DB90 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Smg9Q9DB90 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Smg9Q9DB90 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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