Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pop5Q9DB28 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pop5Q9DB28 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pop5Q9DB28 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pop5Q9DB28 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pop5Q9DB28 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pop5Q9DB28 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pop5Q9DB28 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pop5Q9DB28 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pop5Q9DB28 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pop5Q9DB28 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pop5Q9DB28 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pop5Q9DB28 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pop5Q9DB28 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pop5Q9DB28 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pop5Q9DB28 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pop5Q9DB28 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pop5Q9DB28 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pop5Q9DB28 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pop5Q9DB28 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pop5Q9DB28 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pop5Q9DB28 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pop5Q9DB28 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pop5Q9DB28 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pop5Q9DB28 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pop5Q9DB28 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pop5Q9DB28 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pop5Q9DB28 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pop5Q9DB28 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pop5Q9DB28 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pop5Q9DB28 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pop5Q9DB28 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pop5Q9DB28 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pop5Q9DB28 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pop5Q9DB28 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pop5Q9DB28 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pop5Q9DB28 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pop5Q9DB28 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pop5Q9DB28 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pop5Q9DB28 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pop5Q9DB28 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pop5Q9DB28 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pop5Q9DB28 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pop5Q9DB28 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pop5Q9DB28 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pop5Q9DB28 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pop5Q9DB28 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pop5Q9DB28 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pop5Q9DB28 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pop5Q9DB28 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pop5Q9DB28 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pop5Q9DB28 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pop5Q9DB28 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pop5Q9DB28 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pop5Q9DB28 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pop5Q9DB28 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pop5Q9DB28 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pop5Q9DB28 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pop5Q9DB28 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pop5Q9DB28 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pop5Q9DB28 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pop5Q9DB28 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pop5Q9DB28 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pop5Q9DB28 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pop5Q9DB28 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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