Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA42

Uncharacterized protein C20orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DA42 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9DA42 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Q9DA42 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9DA42 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9DA42 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9DA42 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9DA42 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9DA42 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9DA42 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Q9DA42 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9DA42 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9DA42 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9DA42 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Q9DA42 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9DA42 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9DA42 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9DA42 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9DA42 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Q9DA42 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9DA42 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9DA42 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9DA42 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9DA42 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9DA42 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9DA42 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9DA42 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9DA42 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9DA42 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9DA42 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9DA42 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9DA42 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9DA42 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9DA42 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9DA42 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9DA42 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9DA42 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Q9DA42 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9DA42 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q9DA42 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Q9DA42 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9DA42 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9DA42 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9DA42 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Q9DA42 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9DA42 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9DA42 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9DA42 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9DA42 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9DA42 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Q9DA42 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Q9DA42 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9DA42 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q9DA42 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Q9DA42 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9DA42 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9DA42 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q9DA42 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q9DA42 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q9DA42 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q9DA42 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q9DA42 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q9DA42 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q9DA42 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q9DA42 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q9DA42 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Q9DA42 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9DA42 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9DA42 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9DA42 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9DA42 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9DA42 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9DA42 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9DA42 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9DA42 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9DA42 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9DA42 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9DA42 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9DA42 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9DA42 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9DA42 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9DA42 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9DA42 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9DA42 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9DA42 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9DA42 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9DA42 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9DA42 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9DA42 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9DA42 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9DA42 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9DA42 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Q9DA42 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9DA42 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9DA42 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9DA42 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9DA42 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9DA42 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9DA42 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Q9DA42 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Q9DA42 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms