Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp12Q9D9M2 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp12Q9D9M2 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp12Q9D9M2 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp12Q9D9M2 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp12Q9D9M2 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp12Q9D9M2 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Usp12Q9D9M2 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp12Q9D9M2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp12Q9D9M2 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp12Q9D9M2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp12Q9D9M2 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp12Q9D9M2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp12Q9D9M2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp12Q9D9M2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp12Q9D9M2 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp12Q9D9M2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp12Q9D9M2 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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Usp12Q9D9M2 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Usp12Q9D9M2 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp12Q9D9M2 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp12Q9D9M2 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp12Q9D9M2 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Usp12Q9D9M2 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Usp12Q9D9M2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Usp12Q9D9M2 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Usp12Q9D9M2 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp12Q9D9M2 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Usp12Q9D9M2 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp12Q9D9M2 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp12Q9D9M2 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp12Q9D9M2 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp12Q9D9M2 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp12Q9D9M2 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp12Q9D9M2 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp12Q9D9M2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp12Q9D9M2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp12Q9D9M2 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp12Q9D9M2 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp12Q9D9M2 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp12Q9D9M2 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp12Q9D9M2 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp12Q9D9M2 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp12Q9D9M2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp12Q9D9M2 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp12Q9D9M2 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms