Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg7Q9D906 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg7Q9D906 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg7Q9D906 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg7Q9D906 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg7Q9D906 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg7Q9D906 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg7Q9D906 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg7Q9D906 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg7Q9D906 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg7Q9D906 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg7Q9D906 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg7Q9D906 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg7Q9D906 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg7Q9D906 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg7Q9D906 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg7Q9D906 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg7Q9D906 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg7Q9D906 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg7Q9D906 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg7Q9D906 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg7Q9D906 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg7Q9D906 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg7Q9D906 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg7Q9D906 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg7Q9D906 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg7Q9D906 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg7Q9D906 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg7Q9D906 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg7Q9D906 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg7Q9D906 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg7Q9D906 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg7Q9D906 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg7Q9D906 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Atg7Q9D906 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Atg7Q9D906 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms