Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C4

Ifi35, Interferon-induced 35 kDa protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi35Q9D8C4 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifi35Q9D8C4 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms