Protein–RNA interactions for Protein: Q9D816

Cyp2c55, Cytochrome P450 2C55, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c55Q9D816 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp2c55Q9D816 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp2c55Q9D816 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp2c55Q9D816 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp2c55Q9D816 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp2c55Q9D816 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp2c55Q9D816 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp2c55Q9D816 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp2c55Q9D816 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp2c55Q9D816 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp2c55Q9D816 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp2c55Q9D816 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp2c55Q9D816 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp2c55Q9D816 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp2c55Q9D816 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cyp2c55Q9D816 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cyp2c55Q9D816 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cyp2c55Q9D816 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cyp2c55Q9D816 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cyp2c55Q9D816 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cyp2c55Q9D816 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cyp2c55Q9D816 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cyp2c55Q9D816 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cyp2c55Q9D816 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cyp2c55Q9D816 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cyp2c55Q9D816 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cyp2c55Q9D816 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cyp2c55Q9D816 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cyp2c55Q9D816 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cyp2c55Q9D816 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cyp2c55Q9D816 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cyp2c55Q9D816 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cyp2c55Q9D816 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cyp2c55Q9D816 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cyp2c55Q9D816 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cyp2c55Q9D816 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cyp2c55Q9D816 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cyp2c55Q9D816 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cyp2c55Q9D816 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cyp2c55Q9D816 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cyp2c55Q9D816 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cyp2c55Q9D816 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cyp2c55Q9D816 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp2c55Q9D816 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp2c55Q9D816 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp2c55Q9D816 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp2c55Q9D816 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp2c55Q9D816 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp2c55Q9D816 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp2c55Q9D816 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp2c55Q9D816 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp2c55Q9D816 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp2c55Q9D816 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp2c55Q9D816 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp2c55Q9D816 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp2c55Q9D816 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp2c55Q9D816 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp2c55Q9D816 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp2c55Q9D816 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp2c55Q9D816 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp2c55Q9D816 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp2c55Q9D816 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp2c55Q9D816 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp2c55Q9D816 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp2c55Q9D816 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp2c55Q9D816 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp2c55Q9D816 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp2c55Q9D816 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp2c55Q9D816 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp2c55Q9D816 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp2c55Q9D816 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp2c55Q9D816 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp2c55Q9D816 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp2c55Q9D816 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp2c55Q9D816 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp2c55Q9D816 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp2c55Q9D816 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp2c55Q9D816 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp2c55Q9D816 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp2c55Q9D816 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp2c55Q9D816 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp2c55Q9D816 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp2c55Q9D816 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp2c55Q9D816 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp2c55Q9D816 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp2c55Q9D816 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp2c55Q9D816 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp2c55Q9D816 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp2c55Q9D816 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp2c55Q9D816 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp2c55Q9D816 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp2c55Q9D816 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp2c55Q9D816 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp2c55Q9D816 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp2c55Q9D816 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp2c55Q9D816 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp2c55Q9D816 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp2c55Q9D816 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp2c55Q9D816 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp2c55Q9D816 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms