Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Z6

Clca1, Calcium-activated chloride channel regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca1Q9D7Z6 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca1Q9D7Z6 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms