Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MsraQ9D6Y7 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms