Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y1

Ccdc3, Coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 273 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc3Q9D6Y1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccdc3Q9D6Y1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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