Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rab11fip1Q9D620 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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