Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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PudpQ9D5U5 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PudpQ9D5U5 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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