Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PrameQ9D4Z5 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms