Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf6Q9D4J7 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Phf6Q9D4J7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf6Q9D4J7 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf6Q9D4J7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf6Q9D4J7 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf6Q9D4J7 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf6Q9D4J7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf6Q9D4J7 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf6Q9D4J7 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf6Q9D4J7 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf6Q9D4J7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf6Q9D4J7 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf6Q9D4J7 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf6Q9D4J7 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf6Q9D4J7 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf6Q9D4J7 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf6Q9D4J7 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf6Q9D4J7 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf6Q9D4J7 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf6Q9D4J7 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf6Q9D4J7 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf6Q9D4J7 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf6Q9D4J7 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf6Q9D4J7 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf6Q9D4J7 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf6Q9D4J7 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf6Q9D4J7 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf6Q9D4J7 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf6Q9D4J7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf6Q9D4J7 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Phf6Q9D4J7 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phf6Q9D4J7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms