Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X4

4933428G20Rik, RIKEN cDNA 4933428G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428G20RikQ9D3X4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Myo18a-201ENSMUST00000000645 7307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Myo18a-203ENSMUST00000092887 7304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Spen-202ENSMUST00000105786 12299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms