Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

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Length 818 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx29Q9D3S3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Snx29Q9D3S3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Snx29Q9D3S3 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx29Q9D3S3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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