Protein–RNA interactions for Protein: Q9D350

Obox1, OBOX1, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox1Q9D350 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Obox1Q9D350 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Obox1Q9D350 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Obox1Q9D350 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Obox1Q9D350 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms