Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Spns3Q9D232 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms