Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J3

Sarnp, SAP domain-containing ribonucleoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarnpQ9D1J3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SarnpQ9D1J3 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SarnpQ9D1J3 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SarnpQ9D1J3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SarnpQ9D1J3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SarnpQ9D1J3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SarnpQ9D1J3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SarnpQ9D1J3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SarnpQ9D1J3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SarnpQ9D1J3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SarnpQ9D1J3 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SarnpQ9D1J3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SarnpQ9D1J3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SarnpQ9D1J3 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SarnpQ9D1J3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SarnpQ9D1J3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SarnpQ9D1J3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SarnpQ9D1J3 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SarnpQ9D1J3 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SarnpQ9D1J3 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SarnpQ9D1J3 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SarnpQ9D1J3 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SarnpQ9D1J3 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SarnpQ9D1J3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SarnpQ9D1J3 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SarnpQ9D1J3 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SarnpQ9D1J3 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SarnpQ9D1J3 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SarnpQ9D1J3 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms