Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syf2Q9D198 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Syf2Q9D198 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms