Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M1

Prpsap1, Phosphoribosyl pyrophosphate synthase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpsap1Q9D0M1 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prpsap1Q9D0M1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms