Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Zbed3Q9D0L1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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Zbed3Q9D0L1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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Zbed3Q9D0L1 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zbed3Q9D0L1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms