Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Gtf2e1Q9D0D5 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms