Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW6

Rnf146, E3 ubiquitin-protein ligase RNF146, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf146Q9CZW6 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Rnf146Q9CZW6 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms