Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT8

Rab3b, Ras-related protein Rab-3B, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3bQ9CZT8 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rab3bQ9CZT8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms