Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Shmt2Q9CZN7 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Shmt2Q9CZN7 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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