Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx7Q9CY18 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx7Q9CY18 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms