Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sgo1Q9CXH7 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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