Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RpainQ9CWY9 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms