Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rpusd4Q9CWX4 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rpusd4Q9CWX4 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms